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PCR-, Primer- und Sonden-Design

Der Kurs vermittelt die Planung und Optimierung von PCR- und Real-Time-PCR-Experimenten mit Schwerpunkt auf Primer- und Sonden-Design. Neben den theoretischen Grundlagen werden Zielsequenzen recherchiert und bewertet sowie Primer und Sonden mit verschiedenen Softwarewerkzeugen praktisch geplant und überprüft.

Modus: In-house | Typ: Theorie-, Workshop- und Praxiskurs

Inhalte & Lernziele

Die PCR hat in vielen biologischen Bereichen enorme Fortschritte ermöglicht und wird aufgrund ihrer schnellen, vielseitigen und kostengünstigen Methodik in modernen Laboren in zahlreichen Anwendungsgebieten eingesetzt.

Diese reichen von der klassischen PCR über Multiplex-PCR-Methoden, Long-PCR und Real-Time PCR (qPCR) bis zu komplexen Genexpressionsstudien.

Die richtige Etablierung der PCR sowie die Auswahl geeigneter Zielsequenzen für Primer und Sonden entscheiden häufig über Erfolg und Misserfolg einer PCR. Durch eine sorgfältige initiale Prüfung und Planung lassen sich Fehler vermeiden und robuste Analysen etablieren.

In diesem Kurs lernen Sie die Grundlagen sowie praktische Strategien und Werkzeuge kennen, mit denen Sie Ihre PCR planen, etablieren und optimieren können. Im Workshop wenden Sie die vermittelten Inhalte direkt auf konkrete Sequenzen und Fragestellungen an.

PCR und Primer Design RT-PCR Programme

 

Themen des Theorie-Seminars

  • Einführung in die PCR sowie Real-Time PCR (RT-PCR, qPCR)
  • Planung Ihrer PCR und Real-Time PCR
  • Oligosynthese, LNA-Oligos, Basenanaloga, Additive und Puffer
  • Datenbankrecherche nach Zielsequenzen
  • Strategien für das Primer-Design
  • Primer-Design-Programme
  • Überprüfung der Primer-Spezifität mit BLAST, BLAT und In-silico-PCR
  • ClustalX, BioEdit, Primer3, MultiPLX2.0 und FASTPCR

 

 

Themen des Workshops und der Praxis

Im praktischen Workshop arbeiten Sie mit BLAST und GenBank, dokumentieren Sequenzen mit pDRAW32, erstellen Sequenzalignments mit ClustalX und designen anschließend Primer mit Primer3 oder FASTPCR. Als Übungsbeispiele können unter anderem Primerpaare für ein Genotypisierungsexperiment, eine Multiplex-PCR zum Deletionsscreening und eine Multiplex-qPCR mit mehreren Sondensystemen entwickelt werden.

Bei In-house Schulungen können Sie eigene Fragestellungen und Zielsequenzen einbringen und während des Kurses bearbeiten. Dadurch lassen sich die Übungen direkt an Ihre Anwendungen und Assays anpassen.

Für die praktischen Computerübungen benötigen die Teilnehmer jeweils einen eigenen Laptop mit WLAN-Ausstattung.

 

 

Erweiterungsthemen bei In-house Schulungen

Da der Kurs ausschließlich als In-house Schulung angeboten wird, können Inhalte und Schwerpunkte je nach Bedarf, Vorkenntnissen und Kundenwunsch angepasst, ergänzt oder gekürzt werden. Weitere Themen können z. B. sein:

 

Zielgruppe

Technische oder wissenschaftliche Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter mit Grundkenntnissen in Molekularbiologie und PCR, die PCR-Assays planen, etablieren oder optimieren und Primer bzw. Sonden für ihre Anwendungen selbst auswählen oder designen möchten. Bei der In-house Schulung können Niveau und Schwerpunkte an die Vorkenntnisse und konkreten Anwendungen der Teilnehmer angepasst werden.

 

Termine und Preise In-house Schulungen

Der Kurs PCR-, Primer- und Sonden-Design wird ausschließlich als In-house Schulung angeboten. Kontaktieren Sie uns gerne per E-Mail oder telefonisch. Wir erstellen Ihnen ein individuelles Angebot, das sich nach den gewünschten Inhalten, dem Praxisanteil und der Dauer des In-house Kurses richtet. Den Termin der Schulung stimmen wir individuell mit Ihnen ab. Generell kann ein Kurs innerhalb von 4–8 Wochen nach dem Erstkontakt bei Ihnen durchgeführt werden. Ihre besonderen Wünsche, Anwendungen und Anforderungen besprechen wir vorab in einem zwanglosen und unverbindlichen Telefonat. Unsere Kontaktdaten finden Sie hier.

Die Kursgebühr bei In-house Schulungen beinhaltet die Schulungsunterlagen im Farbdruck, ein Teilnahme-Zertifikat sowie die Reise- und Hotelkosten der Dozentin oder des Dozenten.

 

Vorteile von In-house Schulungen

  • Ab 4–5 Teilnehmern ist eine In-house Schulung günstiger
  • Ihre Mitarbeiter müssen nicht reisen
  • Das Trainingskonzept wird individuell für Sie zusammengestellt und an Ihre Ziele und Mitarbeiter angepasst
  • Eigene Zielsequenzen, Primer, Sonden und Assays können in die Übungen einbezogen werden
  • Konkrete Fragestellungen Ihres Labors können im Workshop gemeinsam bearbeitet werden
  • Alle Mitarbeiter Ihrer Abteilung können an der Entwicklung gemeinsamer Standards beteiligt werden
  • Die Inhalte sind direkt auf Ihre Laboranwendungen und Arbeitsabläufe übertragbar

 

Kursstruktur und Planung

  • Kursbeginn (am ersten Tag) 09:00 Uhr
  • Kursende (bei eintägigen Kursen) ca. 17:00 Uhr
  • Kursende (bei mehrtägigen Kursen bis zum vorletzten Tag) ca. 17:00 Uhr
  • Kursende (bei mehrtägigen Kursen am letzten Tag) ca. 16:00 Uhr

 

Dauer der Fortbildung

Als In-house Schulung kann der Kurs entsprechend Ihren Anforderungen gestaltet werden. Häufig wird er auf 1 Tag konzentriert oder bei umfangreicheren Theorie-, Workshop- und Praxisanteilen auf mehrere Tage erweitert. Die konkrete Dauer richtet sich nach den gewünschten Themen, den Vorkenntnissen der Teilnehmer und den zu bearbeitenden Fragestellungen. Ihre besonderen Wünsche und Anforderungen besprechen wir vorab in einem unverbindlichen Telefonat. Unsere Kontaktdaten finden Sie hier.

 

Ort des Trainings

  • In-house Kurse: Wir kommen zu Ihnen - die Schulung findet bei Ihnen im Unternehmen bzw. Labor statt.

 

Trainingsarten: Theorie, Workshop und Praxis

Der Kurs wird ausschließlich als In-house Schulung durchgeführt. Theorie, Workshop und praktische Computerübungen werden miteinander kombiniert, damit die vermittelten Strategien unmittelbar auf Sequenzen, Primer, Sonden und konkrete PCR-Fragestellungen angewendet werden können. Umfang und Gewichtung der einzelnen Bestandteile können an Ihre Anwendungen und die Vorkenntnisse der Teilnehmer angepasst werden.

  • Theorie: Bestandteil der In-house Schulung
  • Workshop: praktische Arbeit mit Datenbanken und Design-Software
  • Praxis: Bearbeitung eigener oder bereitgestellter Sequenzen und PCR-Fragestellungen

 

Dozent

Dr. Johannes Becker-Follmann studierte Biologie und Philosophie in Saarbrücken und Freiburg. Danach promovierte er am Institut für Humangenetik und Anthropologie der Universität Freiburg zur „Vergleichenden Genkartierung bei Mensch und Maus“. Nach mehreren Forschungsaufenthalten in Osaka (Japan), Freiburg und Berlin gründete er im Jahr 2000 das Institut für Polymorphismus und Mutationsanalytik in Saarbrücken, das Auftragsanalysen mittels PCR, RT-PCR und Sequenzierung (NGS) anbietet. Seit 2002 führt er Seminare und Workshops zu PCR-Themen durch. U. a. war er von 2006 bis 2020 federführender Dozent im Bereich Molekularbiologie, PCR, RT-PCR und NGS bei der PromoCell Academy in Heidelberg. Seit 2017 ist er Leiter des Forschungs- und Entwicklungslabors der Eluthia GmbH und entwickelt Tests für die post- und pränatale Diagnostik.  

 

Autor: Dr. Johannes Becker-Follmann | Fachlich geprüft: Dr. Nicole Kühl | Zuletzt aktualisiert: 20.09.2026

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