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PCR- und Primer-Design

Inhalte & Lernziele

Die PCR hat in vielen biologischen Bereichen enorme Fortschritte initiiert und durch ihre schnelle, einfache, vielseitige und kostengünstige Methodik wird sie nun in modernen Laboren in zahlreichen Anwendungsgebieten eingesetzt. Diese reichen von der regulären PCR über Multiplex-PCR-Methoden, long-PCR und Real Time PCR (qPCR) bis zu komplexen Genexpressionsstudien. Die richtige Planung der PCR sowie die Auswahl der geeigneten Zielsequenzen für die Primer entscheidet dabei oft über Erfolg und Misserfolg der PCR. Durch initiale Prüfung und gute Planung lassen sich Fehler vermeiden und robuste Analysen aufsetzen.

In diesem Kurs lernen sie die Grundlagen sowie Tipps und Tricks, wie Sie Ihre PCR optimal planen und durchführen.

PCR und Primer Design RT-PCR Programme

 

Themen des Theorie-Seminars

  • Einführung in die PCR sowie Real Time PCR (RT-PCR, qPCR)
  • Planung ihrer PCR und Real Time PCR
  • Oligosynthese, LNA-Oligos, Basen-Analoga, Additive und Puffer
  • Datenbank-Recherche nach Zielsequenzen
  • Strategien für das Primer Design
  • Primer-Design-Programme
  • Überprüfung der Primer-Spezifität mit: BLAST, BLAT und in-silico-PCR
  • ClustalX, Bioedit, Primer3, MultiPLX2.0 und FASTPCR

 

 

Themen des Workshops

Im praktischen Workshop-Teil arbeiten Sie mit der Software BLAST, Genbank, dokumentieren mittels pDRAW32, ordnen ihre Sequenzen mit ClustalX an und designen dann  ihre Primer mittels der Softwares Primer3 oder FASTPCR. Als Übungsbeispiele designen wir z.B. Primer-Paare für ein Genotypisierungs-Experiment, für eine Multiplex-PCR zum Deletionsscreening und zuletzt eine Multiplex-qPCR (4 Sonden-System). Gerne können Sie Ihre eigene Fragestellung oder ihre Zielsequenz mit einbringen und bearbeiten.

Für den Übungsteil benötigen sie einen eigenen Laptop mit W-Lan Ausstattung.

 

 

Erweiterungsthemen bei In-house Schulungen

Diese Inhalte werden bei In-house Kursen je nach Bedarf und Kundenwunsch angepaßt, ergänzt und gekürzt. Weitere Themen könnten z.B. sein

  • PCR Basiskurs
  • RT-PCR Basiskurs
  • Multiplex PCR
  • PCR-trouble shooting

 

Zielgruppe

Technische oder wissenschaftliche MitarbeiterInnen mit Grundkenntnissen in der Molekularbiologie und PCR.

 

Dauer der Fortbildung

Offener Kurs: 2 Tage

In-house: Dieser Kurs ist 2-tägig angelegt, wird jedoch je nach Kundenvorgabe oft auf 1 Tag gekürzt oder auf 3-4 Tage ausgeweitet.  Ihre besonderen Wünsche und Anforderungen besprechen wir vorab in einem zwanglosen und unverbindlichen Telefonat. Unsere Kontaktdaten finden Sie hier.

 

Ort des Trainings

Wie bieten Ihnen zwei Arten des Trainings an, je nachdem wie viele Personen geschult werden sollen:

  • Offene Kurse: Sie kommen zu uns - die Wahl für Einzelpersonen
  • In-house Kurse: wir kommen zu Ihnen - die Wahl für mehrere Personen aus einem Unternehmen

 

Trainingsarten: Theorie und Praxis

Um ein effektives Lernen zu fördern, versuchen wir immer Theorieteile und Praxisteile in einem Kurs miteinander zu kombinieren. So kann das neu Erlernte im Labor direkt in die Praxis umgesetzt werden. Feed-back und praktische Übungen helfen dabei, den Lernerfolg zu vertiefen und direkt in Abläufe zu integrieren. Wenn sie jedoch Ihren Mitarbeitern und Kollegen schnell einen Überblick über viele Themen geben wollen, können diese Themen auch in einem Theorie-Seminar interaktiv bearbeitet werden.

  • Theorie: Offene Kurse und In-house Schulungen
  • Praxis: In-house Schulungen
  • Workshops: Offene Kurse und In-house Schulungen

 

Vorteile von In-house Schulungen

  • Ab 4-5 Teilnehmern ist eine In-house Schulung günstiger
  • Ihre Mitarbeiter müssen nicht reisen
  • Das Trainingskonzept wird individuell für sie zusammengestellt und an Ihre Ziele und Mitarbeiter angepasst
  • In Praxisschulungen kann Ihr Assay im Kurs durchgeführt werden, dies hilft beim trouble shooting
  • Alle Mitarbeiter Ihrer Abteilung sind an der Entwicklung neuer Standards aktiv beteiligt. Dies erhöht die Compliance, gerade bei "alten Hasen"
  • Die Praxisteile finden in Ihren Laboren statt und alle Ergebnisse sind direkt übertragbar
  • Optimierungsvorschläge sind so auch bei Räumen und Abläufen möglich

 

Termine und Preise

Anmeldungen für offene Kurse sind derzeit Corona-bedingt nicht möglich.

Für In-house Schulungen kontaktieren sie uns gerne per mail oder telefonisch, dann erstellen wir Ihnen ein individuelles Angebot, das sich nach den Inhalten und der Dauer des In-house Kurses richtet. Bereits ab 4-5 Teilnehmern ist ein In-house-Kurs günstiger als die individuelle Schulung ihrer Mitarbeiter durch Teilnahme an offenen Fortbildungen. Den Termin der Schulung sprechen wir natürlich mit Ihnen ab. Generell kann ein Kurs innerhalb von 4-8 Wochen nach dem Erstkontakt bei Ihnen durchgeführt werden. Ihre besonderen Wünsche und Anforderungen besprechen wir vorab in einem zwanglosen und unverbindlichen Telefonat. Unsere Kontaktdaten finden Sie hier.

Die Kursgebühr bei In-house Schulungen beinhaltet die Schulungsunterlagen im Farbdruck, ein Teilnahme-Zertifikat sowie die Reise- und Hotelkosten der Dozentin oder des Dozenten.

 

Kursstruktur und Planung:

  • Kursbeginn (am ersten Tag) 09:00 Uhr
  • Kursende (bei eintägigen Kursen) ca. 17:00
  • Kursende (bei mehrtägigen Kursen bis zum vorletzten Tag) ca. 17:00 Uhr
  • Kursende (bei mehrtägigen Kursen am letzten Tag) ca. 16:00 Uhr

 

Dozent

Dr. Johannes Becker-Follmann studierte Biologie und Philosophie in Saarbrücken und Freiburg. Danach promovierte er am Institut für Humangenetik und Anthropologie der Universität Freiburg zur “Vergleichenden Genkartierungen bei Mensch und Maus“. Nach mehreren Forschungsaufenthalten in Osaka (Japan), Freiburg und Berlin gründete er im Jahr 2000 das Institut für Polymorphismus und Mutationsanalytik in Saarbrücken, das Auftragsanalysen mittels PCR, RT-PCR- und Sequenzierung (NGS) anbietet. Seit 2002 führt er Seminare und Workshops zu PCR-Themen durch. U.a. war er von 2006 bis 2020 federführender Dozent in Bereich Molekularbiologie, PCR, RT-PCR und NGS bei der PromoCell Academy in Heidelberg. Seit 2017 ist er Leiter des Forschungs- und Entwicklungslabors der Eluthia GmbH und entwickelt Tests für die post- und pränatale Diagnostik.  


 


 

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